หนึ่งในสถานีวิทยุที่ได้รับความนิยมมากที่สุดในซานฮวนคือ WKAQ 580 AM ซึ่งออกอากาศมาตั้งแต่ปี 1922 สถานีนี้ออกอากาศ การผสมผสานระหว่างข่าว กีฬา และทอล์คโชว์ โดยเน้นที่เหตุการณ์ปัจจุบันและการเมือง สถานียอดนิยมอีกแห่งคือ WAPA Radio 680 AM ซึ่งผสมผสานระหว่างข่าว รายการทอล์คโชว์ และรายการเพลง โดยเน้นที่ข่าวท้องถิ่นและระดับชาติ
สำหรับผู้ที่สนใจในดนตรี มีสถานีวิทยุหลายแห่งที่เชี่ยวชาญในด้านต่างๆ ประเภท ตัวอย่างเช่น Salsoul 99.1 FM เป็นสถานียอดนิยมที่เล่นเพลงซัลซ่าและเพลงเขตร้อน ในขณะที่ La X 100.7 FM เล่นเพลงแนวเร็กแกและละตินป๊อป นอกจากนี้ยังมีสถานีที่เปิดเพลงภาษาอังกฤษ เช่น Magic 97.3 FM และ Mix 107.7 FM
นอกจากเพลงและทอล์คโชว์แล้ว สถานีวิทยุหลายแห่งในซานฮวนยังนำเสนอข่าวสารและข้อมูลการจราจรตลอดทั้งวัน ตัวอย่างเช่น NotiUno 630 AM เป็นสถานียอดนิยมที่ให้บริการข่าวสารอัปเดตทุกชั่วโมง พร้อมด้วยรายงานสภาพการจราจรและสภาพอากาศ