Nhạc thay thế đã phát triển mạnh ở Israel từ những năm 1980, với nhiều nhạc sĩ và ban nhạc tài năng tạo ra âm thanh độc đáo pha trộn giữa nhạc rock phương Tây với ảnh hưởng của Trung Đông. Một trong những ban nhạc nổi tiếng nhất trong bối cảnh thay thế là Asaf Avidan & The Mojos, có âm nhạc được đặc trưng bởi giọng hát đặc biệt của Avidan và ca từ đầy chất thơ. Các nghệ sĩ nổi tiếng khác bao gồm The Idan Raichel Project, với âm nhạc pha trộn truyền thống âm nhạc của người Do Thái và Ả Rập, và Balkan Beat Box, với âm nhạc kết hợp giữa âm hưởng Balkan, gypsy và Trung Đông.
Có một số đài phát thanh ở Israel phát nhạc thay thế, trong đó có 88 FM và 106 FM. Các đài này phát nhiều loại nhạc thay thế, từ indie rock đến âm thanh điện tử và thử nghiệm. Ngoài các đài phát thanh, còn có nhiều lễ hội âm nhạc giới thiệu những gì hay nhất của nền âm nhạc thay thế của Israel, chẳng hạn như lễ hội InDNegev và Lễ hội Zorba. Nhìn chung, nền âm nhạc thay thế ở Israel là một nền âm nhạc sôi động và đa dạng, với nhiều nhạc sĩ tài năng vượt qua ranh giới của những gì có thể có trong thể loại này.