Muzika alternative është një zhanër relativisht i fundit në Malajzi, por ka fituar popullaritet në dekadën e fundit. Ky zhanër përfshin nën-zhanre të ndryshme të cilat përfshijnë indie rock, punk, post-punk, rock alternative dhe shoegaze. Karakterizohet nga qasja e tij joortodokse ndaj kompozimit muzikor dhe eksperimentimi me tinguj të ndryshëm. Një nga artistët më të njohur të muzikës alternative të Malajzisë është OAG, i cili qëndron për "Old Automatic Garbage" dhe aktualisht ka katër anëtarë të grupit. Stili i tyre alternativ i muzikës rock është i popullarizuar në mesin e audiencës malajziane dhe u ka fituar atyre disa çmime në vendin e tyre. Një tjetër artist alternativ i njohur është Bittersweet, një grup i njohur për tingujt e tyre të veçantë që ndërthur muzikën tradicionale malajziane me një stil modern rock alternativ. Të njohur për eksperimentimin e tyre muzikor dhe lirik, grupi ka qenë aktiv që nga fillimi i viteve 2000 dhe është i popullarizuar në mesin e të rinjve malajzianë. Vitet e fundit, Malajzia ka parë një trend në rritje të artistëve dhe grupeve të pavarura që shfaqen në skenën e muzikës alternative. Këta muzikantë shpesh përqafojnë etikën DIY dhe vetë-lëshojnë muzikën e tyre. Disa nga grupet e pavarura të njohura janë The Impatient Sisters, Jaggfuzzbeats dhe Bil Musa. Për sa i përket stacioneve radio që luajnë në zhanrin e muzikës alternative, më i popullarizuari është BFM89.9, i cili ka një program javor të quajtur "If It Ain't Live" që përfshin grupe alternative vendase dhe ndërkombëtare. Stacione të tjera që luajnë muzikë alternative përfshijnë Hitz FM dhe Fly FM. Si përfundim, muzika alternative është një zhanër në rritje në Malajzi, me shfaqjen e artistëve dhe grupeve të pavarura që shtojnë diversitetin e saj. OAG dhe Bittersweet mbeten artistë të zakonshëm të njohur, ndërsa rritja e muzikantëve të pavarur tregon se skena alternative po vazhdon të zhvillohet. Me praninë e stacioneve të dedikuara radiofonike, vitaliteti i zhanrit me siguri do të vazhdojë të rritet në skenën muzikore të Malajzisë.