Muzyka klasyczna ma w Estonii bogatą historię, a kompozytorzy tacy jak Arvo Pärt, Eduard Tubin i Veljo Tormis zyskują międzynarodowe uznanie. Arvo Pärt jest prawdopodobnie najbardziej znanym estońskim kompozytorem, znanym ze swojego minimalistycznego i uduchowionego stylu. Jego utwory są regularnie wykonywane przez orkiestry i zespoły na całym świecie.
W Estonii odbywa się też kilka znaczących festiwali muzyki klasycznej, w tym Festiwal Muzyczny w Pärnu, który odbywa się każdego lata i biorą w nim udział światowej sławy muzycy i wykonawcy.
Jeśli chodzi o radio Popularnym wyborem jest kanał muzyki klasycznej Klassikaraadio należący do Estonii Public Broadcasting, który oferuje szeroką gamę programów z muzyką klasyczną, w tym występy lokalnych i międzynarodowych muzyków. Inne stacje radiowe, takie jak Raadio Klassika i Vikerraadio, również nadają programy z muzyką klasyczną.
Oprócz tradycji muzyki klasycznej Estonia ma tętniącą życiem scenę muzyki chóralnej, z wieloma amatorskimi i profesjonalnymi chórami wykonującymi tradycyjne i współczesne utwory chóralne. Chór Kameralny Filharmonii Estońskiej i Narodowa Orkiestra Symfoniczna Estonii należą do najbardziej znanych zespołów muzyki klasycznej w kraju.